北京市第六中学是一所历史悠久、声望较高的老校。她的前身是1923年创立的私立华北中学，我国现代著名教育家、革命先驱、时任北大校长蔡元培先生为学校的首任校长。蔡元培主张“尊师爱生”，发挥“自动性”，强调“德育实为完全人格之本”，上述教育思想，一直传承延续。
1937年，“七七”事变，北平沦陷。1940年，当局改“私立华北中学”为“市立第六中学”，只收男生，从此成为“男六中”。男六中是北平非常有名望的学校，老师们知识渊博、经验丰富，培养了大批优秀人才，六中每年都有较多学生考入北大、清华等著名大学。
1949年北平和平解放，六中逐步发展成为一所党领导下的朝气蓬勃的社会主义新型学校。1961年9月，根据教育部“选定一批重点学校作为提高教育质量骨干校”的精神，北京市教育局对原重点学校做了调整，北京六中仍位列市重点校行列。
1964年，康生直接插手，确定六中为“四清”运动中全国唯一的一所中学试点单位，被扣上“天安门旁的白色据点”、“国民党支部”等罪名，随之而来的无产阶级文化大革命更使六中蒙受了巨大灾难。1968年，六中开始招收女生。
党的十一届三中全会之后，学校全面贯彻落实党的教育方针，面向全体学生，逐步形成了一个团结、实干、坚持改革的领导班子和一支业务扎实、作风严谨、教书育人的教师队伍。学校遵循“严谨、求实、团结、进取”的校训，既重视优良传统，又勇于改革创新，既重视课堂教学，又重视课外活动，形成了学习刻苦、作风朴素、全面发展的好校风，在社会上享有较高声誉。
六中具有一大批教学经验丰富的老教师。六中的“五老”——数学教师李观博、徐春茂，英语教师陈乃甲、张少岩、语文教师邢翰臣，在北京教育界都鼎鼎有名。其中李观博先生是当时北京极少数的特级教师之一，他领导的六中数学教研组堪称北京中学中实力最强。
70余年的历史中，北京六中为国家培养了两万余名合格毕业生，其中包括外国学生、少数民族学生。中央政治局委员、北京市委书记刘淇，原人大副委员长胡启立，原全国政协副主席李蒙，历史学家阎崇年，著名相声艺术家侯耀文，人艺演员蓝荫海等等都是从六中的校园走出的佼佼者。学校曾被全国体委指定为排球传统校和训练基地，六中排球队曾获全国少年组冠军，为我国体育界输送了大批优秀的人才。
1999年，随着西城区教育资源的重新优化整合，北京市第六中学和北京市第二十八中合并为北京市长安中学。